Debes declarar el namespace en el código fuente de tus clases, substituyendo yourcompany por el nombre que quieras darle, mira en la cabecera de los archivos vb asociados a tus ascx.

Hola Jose y Toni.
Creo que no me entendistéis la pregunta.

Los sitios en los que tengo que cambiar el namespace "YourCompany" por el que me interesa los conozco, y de hecho así lo hago. La pregunta va más orientada a si hay alguna forma de configurarlo para que automáticamente salga lo que yo quiero en todos esos lugares y no tener que ir cambiándolo a mano.

Por ejemplo, se que desde el visual studio en un proyecto normal se puede configurar en las propiedades del proyecto para que siempre tome el mismo namespace (incluso hace esto cuando creas una clase dentro de una estructura de carpetas concreta: te pone el namespace de la ruta del proyecto donde está ubicado el nuevo archivo). Pero para un proyecto/solución DNN no encuentro esta opción. No se si existe, de hecho. (Estoy utilizando los template del starterkit para la creación de la estructura de módulos).

Gracias de todos modos :)